因疫情影響養殖產業，行政院農業委員會從109年3月起推動「養殖漁業生產調節獎勵措施」，補助魚塭整池消毒、疏養及延後放養，分散調節生產以維持產銷穩定，並改善養殖生產環境，協助養殖產業化疫情危機為轉機。臺南市計有2,850位漁民登記申請，經農委會漁業署核定符合資格，預計核撥獎勵金5億124萬元。
農業局表示，依據「養殖漁業生產調節獎勵作業規範」，經漁業署核定予以獎勵的養殖漁民，於完成整池消毒、疏養及延後放養作業後，應於110年5月31日前檢附文件，向魚塭所在地公所提出申請撥付獎勵金。截至3月底僅有164位漁民申請，完成獎勵金核撥1,302萬5,184元。
農業局指出，臺南市漁民申請辦理整池消毒項目最多達2,393人，應於110年4月30日前，將魚塭排空且完成清底、曬池、翻土、消毒等作業期間至少達1個月以上，並於110年5月31日前檢附整池消毒施作前、中、後紀錄照片及核銷單據、切結書、撥款帳戶存摺封面影本，依實際施作完成的魚塭口數及面積，至魚塭所在地公所申請撥付獎勵金。
市長黃偉哲表示，政府為振興漁業及照顧漁民，推動「養殖漁業生產調節獎勵措施」，呼籲先前申請經核定符合條件的養殖漁民，務必於5月31日前申請撥付獎勵金，逾期將無法受理。
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