臺南市漁會改選，無論選舉資格、投票辦法與流程公告，均依據中央公布的「漁會選舉罷免辦法」辦理。市政府農業局強調，該局為輔導機關，必定維護漁會改選的公平、公正與公開。
臺南市兩漁會已於3月20日完成漁民小組選舉投票，選出漁民小組長及會員代表，後續將分別於3月31日、4月1日、4月12日、4月13日召開會員代表大會及理、監事會議。
農業局表示，兩漁會後續各項會議及選舉，該局會督促依漁會選舉罷免辦法規定辦理，投票人應親自憑國民身分證領取選舉票，並在投票人名冊上簽名或蓋章，若以按指印代替，應由指導員及發票員簽名證明，而漁會的選舉票，應蓋用漁會圖記及指導員印章才有效。另外，漁會理事、監事選舉，採用無記名連記或限制連記投票法，尊重出席的會員代表選擇。
農業局指出，為求改選順利，該局與臺南市政府警察局及檢調單位合作，積極查察各種陳情，並對外公布檢舉專線，防止暴力、賄選、賭盤及任何不法行為涉入，若發現不法情事，歡迎逕行舉發，不宜匿名散佈傳言。檢舉管道如下：
一、臺南市警局檢舉專線（06）6322185
二、法務部檢舉賄選專線 0800-024099#4
三、臺南市警局網站：https://www.tnpd.gov.tw
四、農委會漁業署聯絡電話（02）23835731
五、臺南市政府農業局漁業科（06）6326349
連絡人：漁業科吳國霖科長 電話：06-6575061、0921-642807