漁業科業務職掌
(一)、漁業管理：
1. 養殖漁業生產專區規劃及設立。
2. 農業用地容許養殖設施使用申請核發。
3. 養殖用地違規及列管污染魚塭土地追蹤。
4. 河川漁業資源保育管理。
5. 七股潟湖、北門潟湖區劃及定置漁業權管理。
6. 養殖放養量申報及查報。
7. 漁業天然災害查報及救助。
8. 徵收魚塭土地養殖水產物遷移費之審核。
9. 廢棄蚵殼處理場及魚貨集貨場管理
10. 養殖水產品飼料管理及水產品上市前抽驗管理
11. 養殖漁業登記證核發。
12. 漁業統計彙整。
(二)、漁業推廣：
1. 水產品產銷履歷及有機水產品推動。
2. 低碳城市養殖漁業推動。
3. 養殖漁業循環水補助設施及節能水車補助計畫。
4. 水產品產銷調節（收購）及水產加工設施之補助計畫。
5. 臺南水產品之推廣促銷。
6. 在地食材之臺南水產推動。
7. 漁業（家政、四健、漁事）推廣。
(三)、漁業輔導：
1. 區漁會（會務、人事、財務、信用、供銷）業務輔導。
2. 魚市場管理及輔導。
3. 水產養殖產銷班輔導設立與評鑑。
4. 養殖休閒漁業管理及輔導。
5. 各漁業團體、養殖生產區管理委員會行政業務輔導。
6. 老漁福利津貼及漁業貸款輔導。
(四)、漁業工程：
1. 推動改善養殖漁業生產區公共設施工程。
2. 委託區公所辦理養殖魚塭集中區公共設施建設。
3. 養殖漁業災損工程勘查及復建。